產(chǎn)品介紹全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)，是結(jié)合重亞硫酸鹽Bisulfite處理和NGS高通量測序技術(shù)，對有參考基因組的物種在全基因組水平進行單堿基分辨率的甲基化檢測，適合各種類型的樣本(細胞、全血、組織、病理切片、血漿cfDNA等)普遍用于人、動物及農(nóng)林牧漁等方向的高水平甲基化研究。
用心服務每一個項目
艾斯團隊專注表觀組學10年，提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;
已經(jīng)完成人、動植物等幾十個物種, 5000+例樣本W(wǎng)GBS項目經(jīng)驗;
已完成常規(guī)樣本、復雜樣本(FFPE)及微量樣本(血漿cfDNA)多種樣本類型項目;
嚴格WGBS建庫質(zhì)控和效率，Bisulfite轉(zhuǎn)化率>99%;
自動化建庫測序流程，保障WGBS周期交付能力;
重點團隊發(fā)表Genome Biol、Nat Commun、Cell Res等高水平SCI文章;
專業(yè)的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析;
每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果
樣本類型和要求
樣本類型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
血漿/血清/cfDNA
建議提供1-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA
細胞、全血、動植物組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
信息分析
WGBS
分析內(nèi)容
備注
標準分析
1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、與參考基因組比對
比對率和覆蓋度分析
3、甲基化位點Calling
評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)
4、甲基化分布圖譜分析
甲基化在基因組、功能元件上的分布
5、組間差異甲基化DMR分析
尋找DMR及注釋
6、差異甲基化基因DMG分析
DMG富集分析GO，KEGG
7、多樣本聚類分析
PCA分析多樣本甲基化變化規(guī)律
高級分析
8、多組學整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
9、其它定制化分析
結(jié)合課題背景亮點挖掘
產(chǎn)品介紹全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)，是結(jié)合重亞硫酸鹽Bisulfite處理和NGS高通量測序技術(shù)，對有參考基因組的物種在全基因組水平進行單堿基分辨率的甲基化檢測，適合各種類型的樣本(細胞、全血、組織、病理切片、血漿cfDNA等)普遍用于人、動物及農(nóng)林牧漁等方向的高水平甲基化研究。
用心服務每一個項目
艾斯團隊專注表觀組學10年，提供專業(yè)有價值的DNA甲基化完整解決方案;
已經(jīng)完成人、動植物等幾十個物種, 5000+例樣本W(wǎng)GBS項目經(jīng)驗;
已完成常規(guī)樣本、復雜樣本(FFPE)及微量樣本(血漿cfDNA)多種樣本類型項目;
嚴格WGBS建庫質(zhì)控和效率，Bisulfite轉(zhuǎn)化率>99%;
自動化建庫測序流程，保障WGBS周期交付能力;
重點團隊發(fā)表Genome Biol、Nat Commun、Cell Res等高水平SCI文章;
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每個項目需要專業(yè)、有價值的建議;及時高效的溝通，以保障高質(zhì)量研究成果
樣本類型和要求
樣本類型
樣本要求
基因組DNA
總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量
血漿/血清/cfDNA
建議提供1-4ml血漿/血清, 或者>15ng cfDNA
細胞、全血、動植物組織等
按照送樣要求準備
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸
信息分析
WGBS
分析內(nèi)容
備注
標準分析
1、測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量
2、與參考基因組比對
比對率和覆蓋度分析
3、甲基化位點Calling
評估胞嘧啶甲基化狀態(tài)
4、甲基化分布圖譜分析
甲基化在基因組、功能元件上的分布
5、組間差異甲基化DMR分析
尋找DMR及注釋
6、差異甲基化基因DMG分析
DMG富集分析GO，KEGG
7、多樣本聚類分析
PCA分析多樣本甲基化變化規(guī)律
高級分析
8、多組學整合關(guān)聯(lián)分析
例如與轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
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